La forma más efectiva de manejar la contaminación es evitar crearla en primer lugar. Ciudades con gran cantidad de industria, la producción tiende a contaminar más. Además, las ciudades con la mayor cantidad de personas también generan mucha contaminación. Aunque temprano en el juego, los niveles de contaminación suelen ser benignos, a medida que te acercas al final de la Edad del Renacimiento y el comienzo de la Edad Moderna, la contaminación comienza a convertirse en un problema.